Ocorrência

The InBIO Barcoding Initiative Database: Portuguese Scorpionflies (Mecoptera, Panorpidae)

Versão mais recente publicado por CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources) Portugal em 3 de Agosto de 2020 CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources) Portugal
The dataset contains 13 records of Scorpionflies (Panorpidae) species collected from 2008 to 2019 in continental Portugal. All captured specimens were identified as Panorpa meridionalis, so far the only species of Mecoptera known to exist in Portugal Specimens were detected and captured by direct search of the environment. Captured specimens were preserved in 96% ethanol. From each specimen one leg (tissue sample) was removed to be used for DNA extraction. Preserved specimens and DNA extracts are deposited in the InBIO Barcoding Initiative (IBI) collection at the CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources). Samples of each species were selected for DNA sequencing based on geographic provenance of the corresponding specimen. Sequencing of the 658 bp DNA barcodes was conduc... Mais

Descrição

The dataset contains 13 records of Scorpionflies (Panorpidae) species collected from 2008 to 2019 in continental Portugal. All captured specimens were identified as Panorpa meridionalis, so far the only species of Mecoptera known to exist in Portugal Specimens were detected and captured by direct search of the environment. Captured specimens were preserved in 96% ethanol. From each specimen one leg (tissue sample) was removed to be used for DNA extraction. Preserved specimens and DNA extracts are deposited in the InBIO Barcoding Initiative (IBI) collection at the CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources). Samples of each species were selected for DNA sequencing based on geographic provenance of the corresponding specimen. Sequencing of the 658 bp DNA barcodes was conducted within the InBIO Barcoding Initiative (IBI) and all DNA sequences were submitted to BOLD (Barcode of Life Data System) and GenBank databases.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 13 registros.

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Versões

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Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Oliveira D, Ferreira S, P. da Silva L, Lopes P B, Sousa P, Beja P (2020): The InBIO Barcoding Initiative Database: Portuguese Scorpionflies (Mecoptera, Panorpidae). v1.7. CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources) Portugal. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/rmj9sz

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources) Portugal. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

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Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 7b84fe1d-42d0-439a-b60f-0b621f7ba93d.  CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources) Portugal publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Portugal.

Palavras-chave

Mecoptera; Panorpidae; Species; Occurrence; Cytochrome c oxidase I (COI); DNA barcode; Continental Portugal; Specimen

Contatos

Quem criou esse recurso:

Daniel Oliveira
Master’s Student
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
Porto
PT
Sónia Ferreira
Post-Doc Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
Porto
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+351 252660411
Luís P. da Silva
Post-Doc Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
Porto
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+351 252660411
Pedro Brito Lopes
Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
Porto
PT
Pedro Sousa
Post-Doc Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
Porto
PT
+351 252660411
Pedro Beja
Coordinating Researcher
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Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
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Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Pedro Beja
Coordinating Researcher
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Sónia Ferreira
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Quem preencher os metadados:

Daniel Oliveira
Master’s Student
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Sónia Ferreira
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Luís P. da Silva
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CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
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Pedro Brito Lopes
Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
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Pedro Sousa
Post-Doc Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
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Pedro Beja
Coordinating Researcher
CIBIO-InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto
Campus Agrário de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, nº 7
4485-661 Vairão
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+351 252660411

Cobertura Geográfica

Continental Portugal

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [39,8, -8,7], Norte Leste [42, -6,4]

Cobertura Taxonômica

This dataset is composed of data relating to 13 specimens of Panorpa meridionalis, the only species of Mecoptera known to occur in Portugal.

Reino  Animalia
Filo  Arthropoda
Class  Insecta
Ordem  Mecoptera
Família  Panorpidae

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2008-06-02 / 2019-06-28

Dados Sobre o Projeto

The InBIO Barcoding Initiative aims to develop a reference collection of DNA barcoding sequences covering Portuguese invertebrate taxa. Within the project, a special focus is afforded to insects, given their relevance to food webs, ecosystems functioning, high diversity and limited number of DNA barcoding sequences of interest.

Título The InBIO Barcoding Initiative Database: Portuguese Scorpionflies (Mecoptera, Panorpidae)
Identificador InBIO Barcoding Initiative
Financiamento InBIO Barcoding Initiative is funded by the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation programme under grant agreement No 668981 and by the project PORBIOTA — Portuguese E-Infrastructure for Information and Research on Biodiversity (POCI-01-0145-FEDER-022127), supported by Operational Thematic Program for Competitiveness and Internationalization (POCI), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (FEDER). The fieldwork benefited from EDP Biodiversity Chair and the FCT project PTDC/ASP-SIL/30250/2017 - POCI-01-0145-FEDER-030250.
Descrição da Área de Estudo Specimens were captured in several field incursions from 2008 to 2019 in in ten localities in the northern half of Portugal, encompassing seven districts.
Descrição do Design The specimens in this dataset were collected in field work incursion carried out between 2008 and 2019, encompassing several sites throughout northern Portugal. Specimens of Mecoptera were detected by direct search.

O pessoal envolvido no projeto:

Métodos de Amostragem

Specimens were captured from 2008 to 2019 in continental Portugal by direct search of ten sampling sites. Captured insects were preserved in 96% ethanol and stored at the InBIO Barcoding Initiative reference collection for downstream molecular analysis. Collected specimens were morphologically identified using a binocular stereoscopic microscope.

Área de Estudo Specimens were collected in ten sites distributed among seven districts in the north of Portugal. Sampling was conducted from 2008 to 2019, in several field work expeditions.
Controle de Qualidade To each specimen the morphological identification was contrasted with the results of the Blast of the newly generated DNA barcodes in BOLD Identification Engine. Prior submission to GBIF, data was checked for errors and inconsistencies with OpenRefine 3.2 (http://openrefine.org/).

Descrição dos passos do método:

  1. Specimens of Mecoptera were captured in continental Portugal from 2008 and 2019 by direct search of the sampling site. Collected specimens were preserved in 96% ethanol prior to storage.
  2. The specimens were morphologically identified resorting to available literature (Ward, 1983; Monserrat and Tillier, 2013).
  3. DNA barcodes were sequenced from 11 specimens. For this, one leg was removed from each individual from which a 658 bp COI DNA barcode fragment was extracted, amplified and sequenced.
  4. All obtained sequences were submitted to BOLD and GenBank databases and to each sequenced specimen the morphological identification was contrasted with the results of the BLAST of the newly generated DNA barcodes in BOLD Identification Engine.
  5. Prior submission to GBIF, data was checked for errors and inconsistencies with OpenRefine 3.2 (http://openrefine.org/).

Dados de Coleção

Nome da Coleção InBIO Barcoding Initiative
Identificador da Coleção 4ec2b246-f5fa-4b90-9a8d-ddafc2a3f970
Identificador da Coleção Parental CIBIO (Research Center in Biodiversity and Genetic Resources) Portugal
Métodos de preservação do espécime Álcool
Unidades de Curadoria Entre 1 e 13 Voucher tube ,  Entre 1 e 13 DNA extractions

Citações bibliográficas

  1. Monserrat, V. J. and Tillier, P. (2013) ‘Sinopsis de los Mecópteros de la Península Ibérica (Insecta, Mecoptera)’, Boletín de la Sociedad Entomológica Aragonesa (S.E.A.), 53(1926), pp. 143–152.
  2. Ward, P. H. (1983) ‘Scorpion-flies of the panorpa cognata-complex in the western palaearctic region (Mecoptera)’, Journal of Natural History, 17(4), pp. 627–645. doi: 10.1080/00222938300770521. doi: 10.1080/00222938300770521

Metadados Adicionais

Propósito The InBIO Barcoding Initiative (IBI) aims to develop a reference collection of DNA barcoding sequences primarily covering Portuguese invertebrate taxa providing a tool in ecological studies.
Identificadores alternativos 7b84fe1d-42d0-439a-b60f-0b621f7ba93d
http://ipt.gbif.pt/ipt/resource?r=ibi_mecoptera